שלב חשוב בכל ניהול פיננסי הוא התאמה בין חשבונות בנק, התאמה בין תשלומים שהתקבלו לתנועות לקוחות או ספקים כדי לסגור חשבוניות מכירה או חשבוניות זיכוי רכש כפי ששולמו.

בעוד שרוב הלקוחות בסביבות B2B משלמים זמן מה לאחר המשלוח, ומשאירים את חשבוניות המכירה שנרשמו פתוחות לסגירה (ליישום) של מחלקת חשבונות עם קבלת התשלום, חלק מחשבוניות המכירה ניתן לשלם באופן מיידי. חשבוניות כאלה מיושמות מיד כשמשולמות כשהן נרשמות בספרים.

ב-Business Central, אחת הדרכים המהירות ביותר לרשום תשלומים היא באמצעות דף יומן התאמת תשלומים על ידי ייבוא קובץ דף חשבון בנק או עדכון. התשלומים מוחלים על רשומות פתוחות של לקוחות או ספקים בהתבסס על התאמות נתונים בין טקסט תשלום ותאריך ערך. ניתן לסקור ולשנות את ההתאמות לפני רישום היומן, ולסגור רישומי פנקס חשבונות בנק עבור רישומי פנקס חשבונות בעת רישום היומן. חשבון הבנק מותאם כאשר כל התשלומים מוחלים.

קיימים דפים אחרים שבהם ניתן לייחס תשלומים או להתאים חשבונות בנק:

התאמות בנק , ניתן להתאים תנועות חשבונות בנק על ידי התאמת תנועות בנק מיובאים עם פקודות יומן חשבון הבנק . כאן ניתן גם להתאים תשלומי צ'קים. למידע נוסף, ראה התאמות בנקים.

יומן תקבולים, שבו ניתן לרשום באופן ידני קבלות על הכרטסת הרלוונטית, לקוחות, או חשבון אחר על ידי הזנת שורת תשלום. ניתן ליישם את הקבלה או ההחזר על חשבונית פתוחה אחת או יותר לפני רישום יומן קבלת המזומנים.

היבטים נוספים של ניהול חובות כוללים גביית יתרות, לרבות חיובי הוצאות מימון, גבייה ותזכורות, והגדרת חשבונות בנק כך שיאפשרו משיכת תשלומי לקוחות מחשבונם באופן אוטומטי.